Jan Brüwer
Forschungsgruppe Durchflusszytometrie
MPI für Marine Mikrobiologie
Celsiusstr. 1
D-28359 Bremen
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1217 |
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Mein Forschungsschwerpunkt
Meine Forschung fokussiert sich auf den bakteriellen Lebenszyklus von Zellteilung bis Mortalität in Umweltbakterien. Dabei benutze ich vor allem verschiedene FISH Methoden und die automatische Bildauswertung von tausenden von Bildern.
Wenn sich eine Zelle teil, verdoppelt sie ihr Genom und muss diese in die zukünftigen Tochterzellen aufteilen. Genau das können wir im Mikroskop sehen und können so die Frequenz der sich teilden Zellen bestimmen, welche linear zu der Zellteilungsrate korreliert ist. Somti können wir den Start des bakteriellen Lebenszyklus erforschen.
Viren sind ein bekannter Mortalitätsfaktor. Owbohl wir viele Viren kennen, wissen wir in Umweltproben nicht, wie viele Wirstzellen von Viren befallen sind. Um dies Herauszufinden, nutzen wir direct-geneFISH um einzelne Viren Gene mit fluoreszenz Farbstoffen einzufärben. Ich kann somit detektieren, wenn eine Zelle mit einem spezifischem Virus infiziert ist.
Folge uns auf Twitter/X: @JanBruewer und @MolEcol_MPIMM.
Veröffentlichungen
2024
Brüwer JD, Sidhu C, Zhao Y, Eich A, Rößler L, Orellana LH, Fuchs B. 2024 Globally occurring pelagiphage infections create ribosome-deprived cells. Nature Communications. [doi: https://doi.org/10.1038/s41467-024-48172-w]
2023
Brüwer JD, Orellana LH, Sidhu C, Klip HC, Meunier CL, Boersma M, Wiltshire KH, Amann R, Fuchs BM. 2023. In situ cell division and mortality rates of SAR11, SAR86, Bacteroidetes, and Aurantivirga during phytoplankton blooms reveal differences in population controls. mSystems. [doi: 10.1128/msystems.01287-22]
2018
Brüwer JD, Voolstra CR. 2018. First insight into the viral community composition of the cnidarian model metaorganism Aiptasia usring RNA-Seq. PeerJ 6e:4449 [doi: 10.7717/peerj.4449 ]
Brüwer JD, Buck-Wiese H. 2018. Reading the book of life - omics as a universal tool across disciplines. Youmares 8 - Oceans Across boundaries: Learning from each other. Springer, Cham, 73-82 [doi: 10.1007/978-3-319-93284-2_6]
2017
Brüwer JD, Agrawal S, Liew YJ, Aranda M, Voolstra CR. 2017. Association of coral algal symbionts with a diverse viral community responsive to heat shock. BMC Microbiology 17(1):174 [doi: 10.1186/s12866-017-1084-5 ]
2016
Buck-Wiese H, Voolstra CR, Brüwer JD. 2016. The metaorganism frontier - Incorporating microbes into the organism's response to environmental change. YOUMARES 7 - conference proceedings. [Link]
Feldarbeit
2020
Eugen Seibold - Azores -> Azores -> Madeira
Fortlaufende Probennahme der Atmosphäre und des Ozeans für mikrobielle und chemische Analysen auf dem spezifisch dafür designten Segelschiff Eugen Seibold.
Helgoland
Fortführung der POMPU Frühjahrskampagne in den Sommer. Probennahme von der Station 'Kabeltonne' für genomische und mikroskopische Analysen. Erste Analysen wurden vor Ort durchgeführt.
2019
Svalbard
Probennahme um die mikrobielle Gemeinschaft und deren Reaktionen auf Substrat Inkubationen von Sedimenten und des Meeres.
2018
Helgoland
Isolierung von Phagen als Mortalitätsfaktoren während einer Frühjahrsblüte. Dies war ein Praktikum mit Nina Bartlau.
2016
Indonesien
Expedition um einen mikrobiellen Krankheitserreger von Korallen im Infopazifik zu identifizieren. Wir haben ein vollständiges mikrobielles Labor im Jungle aufgebaut. Mehr Informationen kann man hier erfahren.